Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ergic3Q9CQE7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ergic3Q9CQE7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms