Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
1700029P11RikQ9CQ68 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms