Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf8Q99PV0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms