Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ino80bQ99PT3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms