Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms