Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pagr1aQ99L02 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms