Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rab28Q99KL7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rab28Q99KL7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rab28Q99KL7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rab28Q99KL7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rab28Q99KL7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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