Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ophn1Q99J31 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ophn1Q99J31 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms