Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trps1Q925H1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trps1Q925H1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trps1Q925H1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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