Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Csmd1Q923L3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Csmd1Q923L3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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