Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms