Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc5a4bQ91ZP4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms