Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam20bQ8VCS3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms