Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Top1mtQ8R4U6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Top1mtQ8R4U6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Top1mtQ8R4U6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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