Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CipcQ8R0W1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CipcQ8R0W1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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