Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mkl1Q8K4J6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms