Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Casc3Q8K3W3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.6 ms