Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms