Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prpf39Q8K2Z2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prpf39Q8K2Z2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prpf39Q8K2Z2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prpf39Q8K2Z2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf39Q8K2Z2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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