Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SrrdQ8K2M3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms