Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc12Q8K2L8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms