Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim68Q8K243 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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