Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FgbQ8K0E8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FgbQ8K0E8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms