Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pkn3Q8K045 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms