Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LgsnQ8CIX8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms