Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ep400Q8CHI8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ep400Q8CHI8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms