Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Csnka2ipQ8CH19 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Csnka2ipQ8CH19 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csnka2ipQ8CH19 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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