Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hpf1Q8CFE2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hpf1Q8CFE2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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