Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms