Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc28aQ8CEI3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc28aQ8CEI3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc28aQ8CEI3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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