Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc17Q8CE13 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc17Q8CE13 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms