Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc38Q8CDN8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc38Q8CDN8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms