Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc27Q8CD92 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc27Q8CD92 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc27Q8CD92 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms