Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RybpQ8CCI5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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