Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SynpoQ8CC35 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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