Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp20Q8C6M1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp20Q8C6M1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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