Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ifi27Q8C6G0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ifi27Q8C6G0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms