Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FarsaQ8C0C7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FarsaQ8C0C7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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