Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Snx16Q8C080 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Snx16Q8C080 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Snx16Q8C080 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Snx16Q8C080 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Snx16Q8C080 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Snx16Q8C080 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx16Q8C080 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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