Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ctdsp2Q8BX07 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdsp2Q8BX07 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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