Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PgghgQ8BP56 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms