Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms