Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpc2Q8BKV1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gpc2Q8BKV1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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