Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nop53Q8BK35 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nop53Q8BK35 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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