Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Atg4bQ8BGE6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Atg4bQ8BGE6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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