Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms