Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ChfrQ810L3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms