Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34b3Q80ZS5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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