Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cracr2bQ80ZJ8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms