Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NischQ80TM9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NischQ80TM9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms